Se la modifica viene fatta con componenti omologati questo non dovrebbe succedere (a me sul 110 e su almeno un altro 696 non è successo). Se invece hai scatalizzato direi che è possibile che il motore se ne accorga.

La miglior cosa, visto che hai già speso per un buon filtro e per gli scarichi è di fare anche la mappa. Non serve farla al banco. Una volta accordato il tutto con una mappa allora si che sentirai la differenza.