per pulirlo lo devo immergere nella benzina senza togliere niente ?

Se puoi smontarla meglio , altrimenti lo immergi tutto

Possibilmente solo la spugna

Quello è metallico si lava tutto

E per quanto lo lascio asciugare?

i FILTRI a cono o circolari, sono filtri da competizione e si riparano con poche cose.
Il fatto che affoghi , sembra un problema di magrezza , dovresti aumentare il getto massimo.

Su un 17,5 il filtro a cono non serve a nulla , altro che a scarburarlo, mentre su un 19 servirebbe, perché ha una configurazione ben diversa sia come spilli sia come afflusso della benzina.

Pulirlo nella benzina va benissimo

Ho portato dal meccanico e ha controllato dalla candela che la carburazione è perfetta, potrebbe essere un problema di trasmissione? (Rulli ecc..)

Potrebbe , devi smontarla e ispezionarla, a volte lo fa quando per esempio si cambia cinghia.
Però scusa prima di mettere il filtro a cono lo faceva?
E se si la trasmissione sempre la stessa?