Devi andare alla Motorizzazione, ti daranno un modulo, dei bollettini per i versamenti e ti diranno di portare delle fotocopie di alcuni documenti, spesa circa 60 euro (viaggi esclusi ),
A questo punto avrai targa e libretto e potrai fare il collaudo, verifica che sia tutto a posto (luci, gomme, scarico etc.) e che il ciclomotore non faccia più di 45 km/h. Naturalmente dovrai pagare bollo e assicurazione per circolare su strada.
Puoi far fare i documenti ad un'agenzia di pratiche auto che dovrà guadagnarci per farti il lavoro.
Il fatto che adesso non sia assicurato e non hai pagato i vecchi bolli non importa.

Se lo scarico è omologato per il tuo mezzo non dovresti avere problemi. Quanto alla leva del freno, sostituiscila

A meno di trovare l'operatore veramente puntiglioso, neanche te lo guarderanno il cruscotto.
Quindi, IMHO, sei abbastanza tranquillo.


EDIT...
Chiedo scusa, ma non avevo visto che dovrai andare obbligatoriamente in MCTC...
A questo punto sei abbastanza "spacciato", perchè lì ti fanno un controllo totale, compreso il cruscotto. Mi sa che ti tocca cambiarlo.

MCTC???? cos'è ????
e perchè devo andarci per forza ????

La Motorizzazione. No, non devi andarci per forza, devi fare solo la revisione, non il collaudo come ho scritto distrattamente sopra. Puoi andare in una officina autorizzata, ricordati che per essere in regola per portarla devi prenotare, farti rilasciare l'attestato, averlo con te e fare solo il percorso più breve per l'officina.