se è a iniezione può essere un problema derivante dalla carburazione e dalla mancanza nella centralina del sensore di pressione atmosferica che compenserebbe i problemi di carburazione a un'altitudine più alta, alcune centraline l'hanno altre non ce l'hanno e da li il problema

non so che anno è il tuo, ma quando l'ho avuto la cosa migliore fu montare un variatore polini.
perderai 2 o 3 km/h di velocità massima ma acquista forza e scatto perché gira di più rispetto all'originale.
Se vuoi fare un intervento ancora più valido: consiglierei anche di cambiare o modificare la scatola filtro aria per farlo respirare di più ma a quel punto necessiterà di una nuova carburazione con gigler più grandi.

se è 2009 a carburatori segui il mio consiglio, il variatore polini lo presi su ebay e lo montato io. ma se non hai gli attrezzi giusti fallo montare da un meccanico.

riguardo al filtro aria più aperto e alla ricarburazione ti ci vuole un meccanico che abbia orecchio, perché è un fai da tè più da esperti.

Se è un problema che persiste solo in salita e in alta montagna secondo me non c'è da preoccuparsi.. è successo anche a me anche se con un piccolo 50cc e quindi il problema è amplificato mille volte.
Quando senti che il motore non ce la fa piu in salita prova a levare completamente il filtro dell'aria dall'airbox e vedrai come sale secondo me è un problema di "mancanza" di aria la quale si fa piu rarefatta e sballa la carburazione come dice bene leleviola. Levando il filtro dell'aria essa entra in quantità maggiore, ma con il problema che entra tutta la sporcizia possibile e immaginabile.
Ovviamente non lo fare, è una semplice supposizione che probabilmente è anche vera facendo un piccolo ragionamento.
P.S. quanti km ha? Prova a cambiare il filtro che potrebbe essere intasato..
P.P.S. il consiglio di installare un variatore aftermarket non la scarterei, potrebbe risolvere il problema

Carica il liberty sul GS e vedi come sale.. scherzo
Prova a prendere questi due accorgimenti:
Cambio filtro dell'aria, o un bel tagliando generale se occorre..
Installazione variatore aftermarket, prova a vedere se ne trovi uno usato ma in buone condizioni..

Vai sul sicuro con il classico multivar della malossi