Dubito che il problema sia individuabile nel regolatore di tensione ... semplicemente da li sospendi l'alimentazione verso la batteria.
Con quel morsetto staccato nel momento in cui metti in moto semplicemente non fornisci energia allo scooter e si alimenterà tramite la batteria fino a quando questa non finirà con lo scaricarsi completamente e a quel punto ti lascerà a piedi.

nel senso che non ricarica più la batteria o cosa?